

高岡智則
年齢:33歳 性別:男性 職業:Webディレクター(兼ライティング・SNS運用担当) 居住地:東京都杉並区・永福町の1LDKマンション 出身地:神奈川県川崎市 身長:176cm 体系:細身〜普通(最近ちょっとお腹が気になる) 血液型:A型 誕生日:1992年11月20日 最終学歴:明治大学・情報コミュニケーション学部卒 通勤:京王井の頭線で渋谷まで(通勤20分) 家族構成:一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹 恋愛事情:独身。彼女は2年いない(本人は「忙しいだけ」と言い張る)
遺伝子型頻度・とは?
遺伝子型頻度 とは、ある遺伝子座において特定の遺伝子型が集団の中でどれくらいの割合を占めているかを表す指標です。遺伝子座には通常二つの対立遺伝子があり、組み合わせ方によって遺伝子型が決まります。例えばある遺伝子座で対立遺伝子が A と a だとすると、遺伝子型は AA, Aa, aa の三通りになります。遺伝子型頻度を知ると、集団全体の遺伝的特徴を把握する手がかりになります。
遺伝子型頻度と allele 頻度 には基本的な違いがあります。遺伝子型頻度は AA, Aa, aa のそれぞれが占める割合、つまり遺伝子型そのものの割合を指します。一方で allele 頻度は対立遺伝子 A と a が全遺伝子としてどれくらいの割合で現れるかを表します。遺伝子型頻度と allele 頻度は互いに関連しており、 Hardy–Weinberg の原理を使うと互換的に考えることができます。
基本的な考え方と計算の仕方
基本的な考え方 は、集団の中のすべての遺伝子を数え、各遺伝子型が何割合を占めるかを求めることです。二つの対立遺伝子がある場合、遺伝子型には三つのパターンがあり、それぞれの頻度を足すと 1 になります。
計算の手順 は以下の通りです。
1) 集団全体の人数を数える。
2) 各遺伝子型の人数を数える(例: AA が 25 人、Aa が 50 人、aa が 25 人)。
3) 各遺伝子型の頻度を 「人数 / 総人数」 で求める。
例題の準備 をします。ある集団があり、100 人います。遺伝子型の内訳は AA が 25 人、Aa が 50 人、aa が 25 人とします。このとき、遺伝子型頻度は次のようになります。
- AA の頻度 = 25 / 100 = 0.25
- Aa の頻度 = 50 / 100 = 0.50
- aa の頻度 = 25 / 100 = 0.25
同時にアルファベット頻度を計算すると、A の総頻度 p は (2×AA + Aa) / (2×総人数) = (2×25 + 50) / 200 = 100 / 200 = 0.50、a の総頻度 q は 1 − p = 0.50 になります。
表で見る遺伝子型頻度の例
| Genotype | <th>CountFrequency | |
|---|---|---|
| AA | 25 | 0.25 |
| Aa | 50 | 0.50 |
| aa | 25 | 0.25 |
この表から、集団の遺伝子型頻度がどのように分布しているかを一目で確認できます。ハーディ–ワインバーグの原理を使うと、p^2 が AA の頻度、2pq が Aa の頻度、q^2 が aa の頻度になると予測される場合があることがわかります。今回の例では p = q = 0.5 なので、予測は AA 0.25、Aa 0.50、aa 0.25 となり、表の値と一致しています。
実生活へのヒント は、遺伝子型頻度を使って集団の遺伝的特徴の傾向を読み解くことです。例えば病気の遺伝子座で、特定の遺伝子型がどのくらい広く分布しているかを知ることで、リスクの推定や予防のヒントにつながることがあります。ただし現実の人間集団では多くの遺伝子座が関与するうえ、環境要因や移動などの影響もあるため単純な予測だけでは済まないことも覚えておきましょう。
まとめとポイント
遺伝子型頻度 は集団内でどの遺伝子型がどれくらいの割合を占めるかを表す基本的な指標です。遺伝子型頻度を知るためには、まず各遺伝子型の人数を数え、全体人数で割るだけです。アルファベット頻度 p と q、そして Hardy–Weinberg の関係を使うと、その他の頻度を予測することができます。表を使って実際のデータを整理すると、理解がさらに深まります。
遺伝子型頻度の同意語
- ジェノタイプ頻度
- 集団内で特定の遺伝子型が現れる割合。AA・Aa・aaのような遺伝子型の出現頻度を指します。
- ジェノタイプの出現頻度
- 遺伝子型が集団内に現れる割合を示す表現。遺伝子型頻度とほぼ同義です。
- 遺伝子型の出現頻度
- 特定の遺伝子型が全個体の中で占める割合を表す指標。
- 遺伝子型の相対頻度
- 全体に対する特定遺伝子型の割合(相対的な比率)を指します。
- 遺伝子型構成比
- 集団内の遺伝子型の構成を割合で表した指標。
- ジェノタイプ構成比
- ジェノタイプの組み合わせが全体に占める割合を示す表現。
- 遺伝子型割合
- 遺伝子型の割合を示す一般的な表現。
- 遺伝子型分布比率
- 集団内の遺伝子型分布を比率として示した考え方。
- 遺伝子型比
- 遺伝子型の割合を簡潔に表す略称的表現。
遺伝子型頻度の対義語・反対語
- 表現型頻度
- 表現型の割合。遺伝子型頻度の対比として用いられ、環境要因の影響を受けやすい点に注意する概念。
- 遺伝子型個体数
- 各遺伝子型に対応する実際の観測個体の数。割合ではなく絶対数で表す考え方。
- 遺伝子型の絶対数
- 遺伝子型ごとの観測個体数を指す。頻度(割合)ではなく実数としてのカウント。
- 遺伝子型固定
- 集団内で特定の遺伝子型のみが存在する状態。遺伝子型頻度が特定の遹果に固定される状況の対義的解釈。
- 遺伝子型多様性
- 集団内に存在する遺伝子型の種類の多さ。頻度そのものではなく、多様性の度合いを示す概念。
遺伝子型頻度の共起語
- アレル頻度
- 集団内で特定の対立遺伝子が占める割合。遺伝子型頻度を理解する際の基礎となる指標で、pやqとして表されることが多い。
- 対立遺伝子
- 遺伝子座を構成する別のバージョンの遺伝子。遺伝子型頻度を決定づける基本単位。
- 遺伝子座
- 同一染色体上の位置で、複数の対立遺伝子(アルレル)が存在する場所。
- 遺伝子プール
- 集団に存在する全遺伝子とその頻度の集合。集団の遺伝的資源とも言える。
- ホモ接合性
- 同じ対立遺伝子を2つ持つ状態。遺伝子型頻度の一種の形態。
- ヘテロ接合性
- 異なる対立遺伝子を1つずつ持つ状態。遺伝子型頻度の重要な構成要素。
- ハーディ-ワインバーグ平衡
- 理想的な条件下で遺伝子頻度と遺伝子型頻度が世代を超えて変わらない理論的状態。
- Hardy-Weinberg比
- HW平衡のもとで遺伝子型頻度が p^2 : 2pq : q^2 の比で表されるとされる比率。
- pとqのアルレ頻度
- 二つの対立遺伝子の集団内での割合。pはある遺伝子の頻度、qはもう一方の頻度を表すことが多い。
- 連鎖不平衡
- 異なる遺伝子座間で遺伝子型の組み合わせが独立に振る舞わない状態。
- 遺伝的漂移
- 小さな集団で偶然の要因により遺伝子頻度が変動する現象。
- 遺伝子流動
- 個体の移動などによって集団間で遺伝子頻度が混ざり、変化する現象。
- 自然選択
- 適応度の差によって遺伝子頻度が変わり、集団の遺伝的構成が変化する進化の機構。
- 近交
- 近親交配によって同じ遺伝子を持つ子孫が増える傾向。
- 近交係数
- 近交の程度を表す指標。集団の遺伝的多様性にも影響を与える。
- 遺伝子多様性
- 集団内の遺伝子の多様性の程度。多様性が高いほど適応の余地が大きい。
- 標本誤差
- 観測データが母集団の真の頻度と異なる原因となるサンプリング上のずれ。
- 多型
- 同一座位に複数の対立遺伝子が存在する状態。遺伝子型頻度の差を生む要因となる。
- 集団構造
- 集団の中にサブ集団が存在し、それぞれで遺伝子頻度が異なる状態。
- 遺伝子型分布
- 集団内での遺伝子型ごとの個体数の分布。遺伝子型頻度の実態を表す指標。
- 実測遺伝子型頻度
- 観測データとして得られた遺伝子型頻度の値。
- 期待遺伝子型頻度
- 前提条件(例: HW平衡)に基づいて予測される遺伝子型頻度の値。
遺伝子型頻度の関連用語
- 遺伝子型頻度
- 集団内で特定の遺伝子型が占める割合。例として AA・Aa・aa の出現比を指す。
- アレル頻度
- 特定のアレルが集団全体で現れる割合。pやqなどの記法で表されることが多い。
- アレル
- 遺伝子座での異なる形の遺伝子。遺伝子の多様性の源となる。例: Aと a。
- 遺伝子座
- 同じ位置にある遺伝子の集合。座ごとに異なるアレルを持つことがある。
- 遺伝子プール
- 集団が保有する全アレルの総体。時間とともに変化して進化を表す。
- ハーディ-ワインバーグ平衡
- 自然選択・遺伝子流動・突然変異・小集団化・非ランダム交配がない場合、世代を超えて遺伝子頻度が一定になる理論上の状態。
- ハーディ-ワインバーグの法則
- p^2 + 2pq + q^2 = 1 の関係と、遺伝子型頻度が p^2, 2pq, q^2 で決まるという法則。
- p(アレルAの頻度)
- アレルAの集団内での頻度。
- q(アレルaの頻度)
- アレルaの集団内での頻度。
- p^2(AA の期待頻度)
- HW平衡下での AA の期待頻度は p の二乗。
- 2pq(Aa の期待頻度)
- HW平衡下での Aa の期待頻度は 2pq。
- q^2(aa の期待頻度)
- HW平衡下での aa の期待頻度は q の二乗。
- 期待遺伝子型頻度
- ハーディ-ワインバーグ平衡の下で予測される各遺伝子型の頻度。
- 観測遺伝子型頻度
- 実際に観察された各遺伝子型の割合。
- ヘテロ接合性
- 異なる2つのアレルを1対持つ遺伝子型。例: Aa。
- ホモ接合性
- 同一のアレルを2つ持つ遺伝子型。例: AA, aa。
- ランダム交配
- 個体が等しい確率で交配相手を選ぶ、HW平衡の基本条件のひとつ。
- 非ランダム交配
- 近縁交配や同質性の高い組み合わせなど、無作為でない交配。
- 選択
- 生存繁殖の成功度合いが遺伝子型頻度に影響を与える現象。
- 遺伝的漂流
- 小規模な集団で起こる、偶然による遺伝子頻度の変動。
- 遺伝子流動(遺伝子流入・流出)
- 集団間でアレルが移動し、頻度を変える現象。
- 突然変異
- 新しいアレルが生じて遺伝子プールに追加される変化。
- 多型(多アレル)
- 同じ遺伝子座に複数のアレルが共存する状態。
- 近交係数(F_IS)
- 系統内の遺伝的近接性・近親交配の程度を示す指標。
- 集団間分化指標(F_ST)
- 異なる集団間の遺伝子頻度の差を示す指標。
- カイ二乗検定
- 観測遺伝子型頻度と期待頻度の乖離を検定する統計手法。
- 観測と期待の乖離を検出
- HW平衡からの逸脱を判断するための検定の目的を表す表現。
- 標本サイズと推定誤差
- 標本サイズが小さいと遺伝子頻度の推定に誤差が大きくなる点。
- 推定方法(最大尤度・ベイズ推定)
- データから頻度を推定する代表的な統計的方法の総称。
- 遺伝子頻度の前提条件
- ランダム交配・無選択・遺伝子流動の欠如など、HW平衡を成立させる前提の総称。
- 実測頻度と期待頻度の比較の意義
- 平衡仮説の検証や進化の原因解明に役立つ観点。
- 二項分布の性質
- 遺伝子型の組み合わせが二項分布に近い性質を持つ場合があるという統計的背景。
- 標本サイズに応じた推定誤差の考え方
- 標本数が多いほど推定が安定し、誤差が小さくなる傾向がある点。



















