αヘリックスとは?初心者にも分かる基本と特徴ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!

  • このエントリーをはてなブックマークに追加
αヘリックスとは?初心者にも分かる基本と特徴ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
この記事を書いた人

高岡智則

年齢:33歳 性別:男性 職業:Webディレクター(兼ライティング・SNS運用担当) 居住地:東京都杉並区・永福町の1LDKマンション 出身地:神奈川県川崎市 身長:176cm 体系:細身〜普通(最近ちょっとお腹が気になる) 血液型:A型 誕生日:1992年11月20日 最終学歴:明治大学・情報コミュニケーション学部卒 通勤:京王井の頭線で渋谷まで(通勤20分) 家族構成:一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹 恋愛事情:独身。彼女は2年いない(本人は「忙しいだけ」と言い張る)


αヘリックスとは?

αヘリックスはタンパク質の二次構造の中でも代表的な折りたたみパターンの一つです。らせん状の形をしており、タンパク質の機能を左右する重要な要素として多くの場面で登場します。この記事では中学生にも分かるように、αヘリックスの基本、安定化のしくみ、実例、歴史、そしてβシートとの違いについて解説します。

そもそもαヘリックスとは

タンパク質は長いアミノ酸の鎖が折りたたまれてできています。その折りたたみ方にはいくつものパターンがあり、その一つがαヘリックスです。αヘリックスは一般に右巻きのらせんで、1回転に約3.6個のアミノ酸が並びます。これをさらに詳しくいうと、1回転の高さは約5.4 Åで、1つのアミノ酸分の縦の距離は約1.5 Åです。

この構造は水素結合という結合の力で安定します。具体的には、i番目のアミノ酸のカルボニル基とi+4番目のアミノ酸のアミノ基の間に水素が橋渡しされ、らせんの内部に規則的な結合が生まれます。水素結合が規則正しく並ぶことで、長い鎖が自然と丸く巻かれて安定します。

αヘリックスの特徴と安定化の理由

αヘリックスの最大の特徴は右巻きのらせんという形と、1回転あたりのアミノ酸数の目安が3.6である点です。水素結合は4番目のアミノ酸間で形成され、シンプルながら強力な安定化を生み出します。このため長い鎖の中でも折りたたみやすく、特定の性質を持つアミノ酸が並ぶ領域では特に強く現れます。

なお、αヘリックスは必ずしも全てが同じ向きではなく、例外として左巻きの構造や、短いαヘリックスが生じることもあります。生体内では周囲の水分量や電荷、温度などの条件によって形が変化することもあります。

αヘリックスの実例と役割

多くのタンパク質にはαヘリックスが含まれ、膜タンパク質の透過部位や酵素の活性部位の一部を形作ることがあります。例えば筋肉を作る構造タンパク質の一部や、機能を安定させる補助領域として現れることが多いです。

身近な例として、ヘモグロビンやインスリンなどの機能を支えるタンパク質の中にもαヘリックスの領域が含まれています。ただし具体的な配列や位置はタンパク質ごとに異なるため、名前だけで全てを決めつけることはできません。

βヘリックスとの違いと三次構造へのつながり

αヘリックスはβシートとは異なる二次構造です。βシートはブロック状の平面状の構造で水素結合の取り方が異なります。これら二つの二次構造が組み合わさって、三次構造と呼ばれる立体が作られます。三次構造が正しく折りたたまれると、タンパク質は本来の機能を発揮します。

歴史的背景

αヘリックスは1951年頃、パウリングと共同研究者コーリー、ブランソンによって提案されました。彼らの研究はタンパク質の二次構造の理解を大きく前進させ、現在の生物物理学の基礎となりました。

まとめと学習のポイント

αヘリックスはタンパク質の基本的な折りたたみ単位の一つで、右巻きのらせん状の形が特徴です。規則的な水素結合により安定し、1回転に3.6個のアミノ酸が並ぶという目安があります。実際のタンパク質では周囲の条件により形が変化することもありますが、αヘリックスは生体内で多くの役割を担う重要な構造です。

ポイント説明
右巻きのαヘリックス
安定化水素結合 i そして i+4 の間で形成
1回転のアミノ酸数約3.6
長さと柔軟性アミノ酸の並び次第で長さが調整される

αヘリックスの同意語

αヘリックス
タンパク質の二次構造の基本形の一つ。ポリペプチド鎖が右巻きの螺旋状に折りたたまれ、水素結合により安定化される構造。
アルファヘリックス
同義。タンパク質の二次構造のうち、右巻きの螺旋状構造を指す名称。
アルファ-ヘリックス
同義。α-ヘリックスの別表記。
α螺旋
α-ヘリックスの略称。ポリペプチド鎖が螺旋状になる二次構造。
アルファ螺旋
同義。α-螺旋の別表現。
アルファ-螺旋
同義。α-螺旋を表す表記の一つ。
α-らせん
α螺旋の日本語風表記。二次構造の名称。
アルファらせん
α螺旋の別表記。二次構造の一種。
αヘリックス構造
タンパク質の二次構造としてのαヘリックスを指す表現。

αヘリックスの対義語・反対語

βシート
αヘリックスの対になる二次構造として、βシート(βプレートとも呼ばれます)があります。平板状の折りたたみにより、縦方向に広がりやすい性質が特徴です。αヘリックスとは異なる折りたたみ方をします。
ランダムコイル
高い規則性を欠く、二次構造をほとんど持たない領域。αヘリックスと対照的に、整った螺旋構造ではありません。
無構造領域
タンパク質の中で、特定の二次構造を持たない、または非常に柔らかく変形する領域。αヘリックスと逆の、非秩序な状態を指す表現です。
左手性αヘリックス
左巻きのαヘリックス(L-αヘリックス)で、一般的な右手性のαヘリックスとは回転方向が反対です。存在は稀ですが概念として対義に位置づけられます。
βヘリックス
β-helix。βシートの規則性をヘリカル状に並べた二次構造の一種で、αヘリックスとは別の形状を取ります。
3-10ヘリックス
3つのアミノ酸ごとに1回転する、別のタイプのヘリックス。αヘリックスとは構造が異なり、対比的に考えられる場合があります。

αヘリックスの共起語

タンパク質
生体を構成する高分子で、αヘリックスはタンパク質の二次構造の一形態です。
二次構造
タンパク質を構成する基本的な構造要素の一つで、αヘリックスはその代表例です。
アミノ酸
αヘリックスはアミノ酸が規則正しく並ぶことで形成される構造です。
アミノ酸残基
アミノ酸の最小単位で、αヘリックスを作る基本ブロックです。
水素結合
αヘリックスを安定化させる主要な結合で、残基間の水素結合が連続します。
ペプチド鎖
アミノ酸がつながった鎖。αヘリックスはこの鎖が規則的に巻いた形です。
i, i+4水素結合
αヘリックスの特徴的な水素結合で、4つ離れた残基間に水素結合が形成されます。
右手性αヘリックス
最も一般的な捻れ方で、右手にねじれたαヘリックスです。
左手性αヘリックス
右手性とは反対に左手にねじれたαヘリックスです(稀な形)。
X線結晶構造
タンパク質の原子レベルの三次元配置を決定する方法の一つです。
X線結晶構造解析
X線結晶構造を解くための手法そのものを指します。
NMR
核磁気共鳴法。溶液中での分子構造を推定する磁気共鳴法で、αヘリックスの情報を得るのに使われます。
円偏光二色性
CDとも呼ばれ、タンパク質の二次構造の割合を推定する実験法です。
CD法
円偏光二色性を用いた実験法で、αヘリックスの含有量を見積もります。
構造生物学
分子の構造と機能を解明する学問分野で、αヘリックス研究の基盤になります
折りたたみ
タンパク質が機能形へと折りたたまれる過程で、αヘリックスの形成が重要な局面です。
安定性
αヘリックスの安定性は水素結合や疎水性コアの性質で決まります。
熱力学
折りたたみのエネルギー変化を扱う分野で、αヘリックスの形成には熱力学が関与します。
PDB
Protein Data Bank の略で、αヘリックスを含む多くの構造データが蓄積されています。
ヘリックス領域
タンパク質の中でαヘリックスとして折りたたまれている領域のこと。

αヘリックスの関連用語

αヘリックス
タンパク質の二次構造の一種で、右手方向のらせん状構造。1回転に約3.6残基、全長約5.4 Å。水素結合はiとi+4の間で安定化され、側鎖は外側へ向く。N末端とC末端のマクロジポールが生じることがある。
アルファヘリックス
αヘリックスの別称。日本語表記や英語由来の表記の違いのみ。
二次構造
タンパク質を構成する大きな要素のひとつ。主なものにはαヘリックス、βシート、ループなどがある。
βシート
別の代表的な二次構造。β鎖が並んで平面状のシートを作る構造。
水素結合
分子内の正電荷と負電荷の間の安定化を生む相互作用。αヘリックスではiとi+4の間の水素結合が特徴。
i+4水素結合
αヘリックス特有の水素結合様式。ペプチド骨格のC=OとN–Hがiとi+4で結合する。
3.6残基/1回転
1周あたりに現れる残基数(おおよそ3.6)。
5.4Å/回転
1周の高さ。αヘリックスの公称長さの目安。
右手ヘリックス
最も一般的な方向のαヘリックス。右手方向に巻く螺旋。
左手ヘリックス
希に現れる左手方向の螺旋。自然界のαヘリックスはほとんどが右手。
3-10ヘリックス
別のタイプの螺旋。1周あたり約3残基、iとi+3の水素結合が特徴。
πヘリックス
より長い螺旋で、1周あたり約4.4残基。iとi+5の水素結合が関与。
プロリン
ヘリックスの終端を破壊しやすい残基。特にαヘリックスの内部では不利になることが多い。
グリシン
柔軟性が高く、局所構造を崩しやすい場合がある。β・αヘリックスどちらにも影響。
アラニン
ヘリックス形成傾向が高いアミノ酸。αヘリックスの安定化を促す。
ヘリックスキャッピング
N端・C端での終端安定化を助ける残基配置・モチーフ。
Nキャップ残基
N末端側の安定化に寄与する残基。
Cキャップ残基
C末端側の安定化に寄与する残基。
アンフィパチックαヘリックス
一方の面に疎水性、もう一方に親水性の残基が配置されたαヘリックス。
膜貫通αヘリックス
細胞膜を横断する長くて疎水性のαヘリックス領域。
ヘリックス-ターン-ヘリックスモチーフ
DNA結合タンパク質などに見られる、αヘリックスの組み合わせ
コイルコイル
複数のαヘリックスが絡み合い、二次構造として現れるモチーフ。
Chou-Fasman予測法
古典的なアミノ酸残基のヘリックス傾向予測法。
PSIPRED
機械学習ベースの二次構造予測ツール。高精度な予測を提供。
JPred
ウェブベースの二次構造予測サービス。
DSSP
3D構造データから二次構造を割り当てる標準的なツール。
STRIDE
二次構造を割り当てる別のツールセット。
Ramachandran図
タンパク質のφ/ψ角の分布を可視化する図。αヘリックスに典型的な角域がある。
φ/ψ角
二次構造の決定に関わる角度。αヘリックスではおおむねφ約-57°, ψ約-47°付近
マクロジポール
αヘリックスに沿ってペプチド結合の極性が並ぶことで生じる全体的な極性モーメント。
Circular dichroism分光法
CD分光法でαヘリックス含有量を見積もる実験手法。
NMR
核磁気共鳴法。局所構造や動的情報を得る手法。
X線結晶構造
X線結晶構造解析によってαヘリックスの正確な空間配置を決定。
タンパク質折りたたみ
タンパク質が三次元構造へ折りたたまれる過程。αヘリックスは初期安定化要素となることが多い。
ヘリックス安定化
水素結合、疎水性相互作用、マクロジポールなどによって安定化する。
ヘリックス終端キャッピング
N端・C端のキャップ残基が安定性に寄与する現象。
ヘリックス予測アルゴリズム
配列データからαヘリックスの存在位置を推定する手法群。
アミノ酸残基のヘリックス傾向スケール
各アミノ酸がヘリックスを形成しやすいかを数値で表した指標。
アラニン優位ヘリックス
アラニンは特にヘリックスを安定化しやすいとされる代表的な残基。
膜環境とαヘリックス
膜貫通領域では疎水性残基が並びやすい。
ヘリックスの機能的役割
構造の安定化だけでなく、膜貫通、DNA結合、信号伝達など多様な機能に寄与。
PDB
Protein Data Bank。3D構造データベース。αヘリックス含有タンパク質の構造情報を提供。
DSSP/STRIDEの使い分け
二次構造の割り当て方の違い。目的に応じて使い分ける。
ヘリックス傾向の設計応用
ヘリックス安定化を狙ったペプチド設計・蛋白工学の基本概念。

αヘリックスのおすすめ参考サイト


学問の人気記事

トルクの単位・とは?初心者向けに徹底解説!なぜ単位が違うのかまで分かる共起語・同意語・対義語も併せて解説!
1133viws
引用・参考文献とは?初心者でもわかる使い方とポイント解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!
543viws
示差走査熱量測定とは?初心者向けガイドで学ぶ基本と実験のポイント共起語・同意語・対義語も併せて解説!
445viws
no・とは?初心者にもわかる意味と使い方ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
411viws
絶縁抵抗値とは?初心者でも分かる測定の基本と安全のコツ共起語・同意語・対義語も併せて解説!
381viws
ナイロン樹脂とは?初心者にもわかる基本と用途ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
364viws
summarize・とは?初心者向け解説と使い方のコツ共起語・同意語・対義語も併せて解説!
344viws
welchのt検定とは?不等分散のデータを比較する統計手法をやさしく解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!
304viws
穴加工・とは?初心者が知っておく基本と現場での活用ポイント共起語・同意語・対義語も併せて解説!
302viws
3/4・とは?分数の基本を分かりやすく解く完全ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
270viws
論述問題・とは?初心者にも分かる解説と解き方のコツ共起語・同意語・対義語も併せて解説!
266viws
ensureとは?初心者にもわかる意味と使い方を徹底解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!
237viws
z変換・とは?初心者が知っておくべき基礎と日常への応用共起語・同意語・対義語も併せて解説!
225viws
洗浄バリデーションとは?初心者が押さえる基本と実務のポイント共起語・同意語・対義語も併せて解説!
219viws
ダーウィンの進化論とは?中学生にも分かるやさしい解説と身近な例共起語・同意語・対義語も併せて解説!
214viws
超音波探傷・とは? 初心者向けのやさしい解説と身近な活用共起語・同意語・対義語も併せて解説!
209viws
座標計算・とは?初心者向けガイドで完全マスター共起語・同意語・対義語も併せて解説!
204viws
摘要とは?初心者にも分かる意味と書き方ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
202viws
空気圧センサーとは?初めてでも分かる仕組みと身近な活用事例共起語・同意語・対義語も併せて解説!
194viws
気圧の単位とは?中学生にもわかるPa・atm・bar・Torrの違いと換算ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
184viws

新着記事

学問の関連記事