ゲノム全体・とは?を知ろう:初心者向けのやさしい解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!

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ゲノム全体・とは?を知ろう:初心者向けのやさしい解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!
この記事を書いた人

高岡智則

年齢:33歳 性別:男性 職業:Webディレクター(兼ライティング・SNS運用担当) 居住地:東京都杉並区・永福町の1LDKマンション 出身地:神奈川県川崎市 身長:176cm 体系:細身〜普通(最近ちょっとお腹が気になる) 血液型:A型 誕生日:1992年11月20日 最終学歴:明治大学・情報コミュニケーション学部卒 通勤:京王井の頭線で渋谷まで(通勤20分) 家族構成:一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹 恋愛事情:独身。彼女は2年いない(本人は「忙しいだけ」と言い張る)


「ゲノム全体・とは?」は、生物の遺伝情報の全体を表す重要な用語です。DNAには、私たちの体を作る設計図がたくさん詰まっています。この設計図をすべて読むことを「ゲノム全体を調べる」「ゲノム全体を解読する」と言います。ゲノム全体は、遺伝子だけでなく遺伝子の周囲の領域や調節して働く部分、繰り返しのDNAなども含みます。これらの情報を組み合わせると、私たちの体の仕組みや、病気がどう生まれるかをより深く理解できます。

ゲノム全体・とは?の基本

ここでは、ゲノム全体と遺伝子の違いをやさしく説明します。

ゲノム全体と遺伝子の違い

遺伝子は、体の作り方の設計図の一部。タンパク質を作る手順を決める情報で、身長や髪の色、目の色などの特徴に関係します。

一方でゲノム全体は、遺伝子を含むすべてのDNA情報を指す、もっと広い意味の言葉です。DNAは長い文字列のようなもので、遺伝子以外の部分も、細胞の働き方を決める重要な役割を担っています。

なぜ「ゲノム全体」を調べるのか

ゲノム全体を調べると、病気の原因となる組み合わせや、薬が体のどの部分にどう働くかを予測できます。個人ごとにDNAの順番は少しずつ違うため、同じ薬でも効き方が違うことがあります。これを理解するのが、ゲノム医療の目標の一つです。

ゲノム全体のデータと技術

現在は次世代シーケンシングと呼ばれる技術を使い、DNAの順番を高速に読み取ることができます。昔は全ゲノムを読むのに長い時間がかかりましたが、今では多くのデータを数日で得られることもあります。読まれた順序は、コンピューターで整理され、病気の予防や治療法の開発、薬の選び方の研究に役立ちます。

用語のひとこと table

ゲノム全体生物のDNAの全体を指します。遺伝子だけでなく周辺情報も含みます。
遺伝子タンパク質を作る設計図の一部。体の特徴に関係します。
配列DNAの並び方の順番。アルファベットのような文字列です。
次世代シーケンシングDNAの順番を高速に読み取る技術。多くのデータを一度に得られます。

ゲノム全体の活用例

・医療の個別化(個人に合わせた治療の設計)

・疾病リスクの予測研究

新しい薬の開発の手助け

まとめ

ゲノム全体・とは?は、遺伝子だけでなく全DNA情報を指す言葉です。全体を理解することで、私たちの体の成り立ちや病気の仕組み、より良い治療の道が見えてきます。専門的な研究の世界ですが、基本の考え方はとても身近です。ポイントは「全体を見ること」と「遺伝子以外の周辺情報も含めて理解すること」です


ゲノム全体の同意語

全ゲノム
生物のゲノム全体を指す表現。遺伝情報の全体を意味します。
ゲノム全体
ゲノムの全体、全ての遺伝情報を含む範囲を指す表現です。
全ゲノム情報
ゲノムに含まれる全ての情報の集合を指す語です。
全ゲノムデータ
ゲノム全体に関するデータ(シーケンスデータや特徴情報など)を指します。
ゲノム全域
ゲノムの全領域を意味します。広く全体を表す言い方です。
遺伝情報全体
生物の遺伝情報のすべてを指す表現で、ゲノム全体を含む意味合いです。
全遺伝子情報
全ての遺伝子情報を含むデータの集合を表します。
全ゲノム配列
ゲノム全体の塩基配列を指す表現で、配列データが前提となります。
ゲノム全体像
ゲノムの全体像、すべての要素を俯瞰したイメージを表します。
全ゲノムシーケンス
全ゲノムを対象にした配列決定プロセス(シーケンス)やそのデータを指します。
ゲノム総体
ゲノム全体を指す別表現。全体性を強調する言い方です。

ゲノム全体の対義語・反対語

ゲノムの一部
ゲノム全体ではなく、特定の領域だけを指す意味。全体像を欠いた視点で、狭い範囲の情報や分析に用いられる表現。
部分ゲノム
ゲノムの一部だけを対象とする概念。網羅的な全体像ではなく、局所的・限定的な範囲の情報を示す言い方。
ゲノム断片
ゲノムを断片的に捉えた表現。連続性がない欠落状態を含むイメージ。
遺伝子単位
ゲノム全体を扱うのではなく、々の遺伝子に焦点を当てる視点・データのこと。
遺伝子レベル
遺伝子単位・個別の遺伝子情報を指す表現。ゲノム全体の俯瞰を避けるニュアンス。
局所的ゲノム情報
全体を網羅する情報に対して、狭い範囲の情報のみを指す表現。
特定領域のみ
特定の遺伝子領域など、限定された領域だけを扱うことを意味する表現。

ゲノム全体の共起語

全ゲノム
ゲノム全体を指す表現で、遺伝情報の全域を対象とする際に使われる語
全ゲノムシーケンス
全ゲノムを一括で読み取る技術。英語の Whole-genome sequencing の日本語表現
ゲノム全体解析
ゲノム全体を対象としたデータ処理・解析の総称。配列品質管理・アラインメント・変異検出・機能予測などを含む
ゲノムワイド関連解析
ゲノム全体を対象とした統計的関連解析。疾病や表現型と関連する遺伝子変異を全ゲノム規模で探す研究手法
GWAS
ゲノムワイド関連解析の略称。全ゲノム尺度で表現型と関連する遺伝変異を検出する研究
全ゲノムQTLマッピング
全ゲノム領域を対象に表現型と遺伝子座の関連を検出する解析
バリアント
ゲノム上の変異の総称。SNP・インデルなどを含む
SNP
ひと塩基多型。ゲノム中の最も一般的な変異のタイプ
INDEL
挿入・欠失変異。ゲノム配列の小さな挿入・欠失を指す
リファレンスゲノム
比較対象となる標準的なゲノム配列。全ゲノム解析の基準となる参照点
アライメント
シーケンスリードをリファレンスゲノムに対して整列させる作業
アノテーション
検出された変異や機能要素を遺伝子情報と結びつける作業
ゲノムデータ
全ゲノムから得られる配列データ・変異データ・関連データの総称
品質管理
全ゲノムデータの品質を保証するための検査・処理手順(欠損・誤りの管理など)

ゲノム全体の関連用語

ゲノム
生物の全遺伝情報の総称で、DNA配列と遺伝子・制御要素を含みます。
全ゲノムシーケンス(WGS)
個体のゲノム全長を一括で読み取り、配列として解読する技術です。
ゲノムアセンブリ
測定したDNA読み取りをつなぎ合わせ、元のゲノム配列を復元する作業です。
デノボアセンブリ
参照配列を使わずに新規ゲノムを組み立てる方法です。
リファレンスゲノム
標準とされるゲノム配列で、比較や注釈の基準になります。
リファレンスベースアセンブリ
既存のリファレンスを利用して新規ゲノムを構築する方法です。
ゲノム注釈
ゲノム配列上の遺伝子、転写産物、調節要素などの機能を特定し付与します。
遺伝子
遺伝情報を担い、体の形質や機能を決定する基本単位です。
コードRNA
タンパク質へ翻訳されないRNA分子で、遺伝子発現の調節などを担います。
プロモーター
遺伝子の転写を開始するDNA上の領域です。
エンハンサー
転写活性を高める遠隔の調節要素です。
エクソン
遺伝子のタンパク質をコードする領域です。
イントロン
エクソン間の非コード領域で、転写後にスプライシングされます。
遺伝子予測
ゲノム中の遺伝子の位置と構造を自動で推定する技術です。
ゲノムワイド関連解析(GWAS)
集団全体でSNPと表現型の関連を調べる解析です。
一塩基多型(SNP)
個体間で最も頻繁に見られる塩基の差です。
挿入欠失(Indel)
DNA配列の挿入または欠失による変異です。
コピー数変異(CNV)
ゲノム領域のコピー数が増減する変異です。
変異
ゲノム配列の差異全般を指します。
NGS(次世代シーケンス)
大量のDNAを高速に読み取る現代的なシーケンス技術の総称です。
ショットガンシーケンス
ゲノムを断片化して読み取り、アセンブリする古典的な手法です。
ペアエンドリード
両端を読むペア読み取りで、長距離の情報を得やすくします。
短鎖リード
比較的短い長さのDNA読み取りです。
長鎖リード
長い読み取り長のデータで、複雑領域の解決に有利です。
アライメント
読み取りを参照ゲノムへ正確に配置する作業です。
リファレンスマッピング
読み取りをリファレンスに位置づけることです。
アライメントアルゴリズム
リードをゲノムへマッピングする計算手法で、代表例にBWAやBowtie、Minimap2があります。
FASTQ/FASTA
DNA配列データの代表的なファイル形式。FASTQは品質情報を含みます、FASTAは配列のみです。
SAM/BAM
アライメント情報を格納するファイル形式です。BAMは圧縮版です。
VCF
変異情報を記録する標準フォーマットで、SNPやIndel、CNVの情報を含みます。
GFF/GTF
ゲノム注釈の標準フォーマット。遺伝子や転写要素の座標情報を表します。
BED
ゲノム領域を簡潔に表すフォーマットで、プロモーターやエンハンサーの座標記述などに使われます。
リファレンスデータベース
Ensembl、NCBI、UCSC など、公開されているゲノムデータの集積データベースです。
エピゲノム
DNAメチル化やヒストン修飾など、遺伝子発現に影響を与える遺伝子外の情報です。
DNAメチル
DNAの化学修飾の一つで、遺伝子発現の調節に関与します。
3Dゲノム
染色体が三次元空間でどう折り畳まれるかを指す概念です。
Hi-C
3Dゲノム構造を解析する実験技法です。
品質管理(QC)
データの品質を評価し、問題を修正するプロセスです。
N50
ゲノムアセンブリの長さ分布を表す指標で、半分の断片がこの長さ以上です。
GC含量
ゲノム中のGとCの割合を示す指標で、配列の特徴を表します。
倫理・プライバシー
ゲノムデータの取り扱いに関する倫理的配慮と個人情報の保護です。

ゲノム全体のおすすめ参考サイト


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