rna抽出・とは?初心者向けにわかりやすく解説する入門ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!

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rna抽出・とは?初心者向けにわかりやすく解説する入門ガイド共起語・同意語・対義語も併せて解説!
この記事を書いた人

高岡智則

年齢:33歳 性別:男性 職業:Webディレクター(兼ライティング・SNS運用担当) 居住地:東京都杉並区・永福町の1LDKマンション 出身地:神奈川県川崎市 身長:176cm 体系:細身〜普通(最近ちょっとお腹が気になる) 血液型:A型 誕生日:1992年11月20日 最終学歴:明治大学・情報コミュニケーション学部卒 通勤:京王井の頭線で渋谷まで(通勤20分) 家族構成:一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹 恋愛事情:独身。彼女は2年いない(本人は「忙しいだけ」と言い張る)


rna抽出・とは?初心者向けのやさしい入門ガイド

RNAは細胞内の遺伝情報を一時的に運ぶ重要な分子です。DNAと似ていますが、RNAはとても不安定で、触れるだけで分解されやすい性質を持っています。研究でRNAを取り出す作業は RNA抽出 と呼ばれ、分離後の品質が実験の成功を大きく左右します。この記事では、中学生にもわかるように、 RNA抽出 がどんなことか、どんな場面で使われるのかをやさしく説明します。

RNA抽出の基本的な考え方

RNA抽出の基本的な考え方は、細胞や組織の中からRNAを取り出し、他の分子(DNA・タンパク質など)から分離することです。これを実現するには、まず細胞を壊してRNAを取り出せる状態にし、次にRNAが分解されないように RNase(RNAを分解する酵素)をできるだけ排除します。現場では“RNaseフリー”と呼ばれる清潔な環境を整えることが重要です。

RNA抽出の代表的な方法

代表的な方法には大きく分けて2つあります。1つは TRIzol法のような有機溶媒を使う方法、もう1つは カラム法のような市販のキットを使う方法です。いずれも目的は「RNAを他の成分から分離し、RNAとして取り出す」ことです。なお、実験室では安全第一で進められるよう、経験者の指導の下で手順を守ります。

RNA抽出の高レベルな流れ

以下は具体的な手順ではなく、基本的な考え方の流れです。順番をざっくり理解しておくと、卒業研究や授業で話を聞くときにも役立ちます。

1) 準備とRNase対策: 実験台を清潔に保ち、RNA分解を防ぐ。耐熱手袋や清浄な器具を使います。

2) 破砕・裂解: 細胞膜を壊してRNAを外に出しやすくします。RNAは水分と共に安定に取り出すことが重要です。

3) RNAの分離・精製: RNAをDNA・タンパク質などの混ざり物から分離し、純度を高めます。抽出方法によって粗い成分を取り除きます。

4) 品質確認・保存: 得られたRNAの品質と濃度を確認し、適切な条件で保存します。長期保存には低温が必要です。

表で見るRNA抽出の要点

項目説明ポイント
準備とRNase対策実験環境をRNaseフリーに保つRNase-free環境を徹底
破砕・裂解細胞を壊してRNAを取り出すRNAが分解されないよう迅速に作業
分離・精製RNAを他成分から分離して清浄化不純物が少ないほど品質が良い
品質確認・保存純度・濃度を測定し適切に保存保存は-80°Cが一般的

よくある質問と注意点

RNAは非常に敏感な分子なので、以下の点に注意しましょう。RNaseの混入を避ける低温保存、そして新鮮な試料の取り扱いなどです。もし初めてRNA抽出を学ぶ場合は、教員や研究室の指導の下で行い、危険な薬品や手順には自分だけで触れないようにしましょう。

まとめ

RNA抽出は、細胞の中からRNAを取り出す基本的な技術です。RNAは不安定なため、清潔な環境と適切な保存条件が成功のカギになります。この記事では、初心者向けに考え方と代表的な方法、そして高レベルの流れを紹介しました。表を活用してポイントを押さえ、用語の意味を理解することから始めれば、より深く学ぶ準備が整います。


rna抽出の同意語

RNA抽出
サンプル中のRNAを分離して取り出す作業の総称。血液・組織・細胞などの生物材料からRNAを取り出す目的で用いられる工程を指します。
RNA抽出法
RNAを抽出するための方法や手法の総称。フェノール/クロロホルム法やTRIzol法、カラム法などRNAを取り出す手法を含み、材料や目的によって選択肢が異なります
RNA抽出プロセス
RNAを抽出する一連の工程のこと。細胞の破砕・核酸の分離・RNAの回収といった複数の段階を指します。
RNA回収
RNAをサンプルから取り出して得る行為を指す語。抽出の結果としてRNAを手元に残すことを意味します。
核酸抽出
DNAとRNAを含む核酸全体を抽出する作業の総称。RNA抽出に含まれる要素であり、文脈によってRNAに特化した意で使われることもあります。
RNA分離
RNAを他の分子(DNA・タンパク質など)から分離して取り出す工程を指します。抽出の一部として使われることが多い用語です。
RNA抽出手順
RNAを抽出する際の具体的な順序や手順を指す語。実際のやり方は試薬や機器によって異なりますが、基本的な考え方は“分離と回収”です。
核酸回収法
核酸のうちRNAを回収する方法の総称。DNAを同時に回収するケースもあるため、文脈でRNAに特化して使われることがあります。

rna抽出の対義語・反対語

RNA合成
RNAを新しく生成するプロセス。RNA抽出が既存RNAを細胞や試料から取り出す操作であるのに対し、RNA合成はRNA分子を“作る”方向の概念です。
RNA生成
RNAを生成・作成する行為。RNA抽出の逆方向の活動として捉えられます。
RNA作成
RNAの新規作成を示す表現。抽出の反対イメージとして挙げられることがあります。
RNA生産
RNAを生産・合成すること。抽出とは別の流れの操作を指します。
RNA蓄積
細胞内でRNAが蓄積・増加する状態。抽出はこのRNAを“取り出す”操作なので、蓄積は内部に保持する概念として対比されます。
RNA保持
RNAを内部に保持・とどめること。抽出して外部へ取り出すのとは反対の方向性を示すことがあります。
RNA保存
RNAを安定に保存・長期保存すること。抽出後の処理でRNAを取り出すのに対して、保存は内部あるいは元の状態を維持する意味合いとなります。
RNA不活性化
RNAを不活性化して機能を失わせる操作。抽出によってRNAを取り出す過程とは、機能を保つ方向性が反対になると考えられます。
RNA分解
RNAを分解・壊すこと。抽出がRNAを取り出す行為であるのに対し、分解はRNAを破壊する方向の対概念として挙げられます。
DNA抽出
RNAではなくDNAを抽出する行為。RNA抽出の対義語として扱われることもありますが、対象分子が異なる点に留意してください。

rna抽出の共起語

RNA抽出
細胞や組織からRNAを取り出し、分析や用途に使える状態にする作業の総称
TRIzol法
トリゾール系試薬を用いるRNA抽出法の代表格。RNAをDNA・タンパク質と分離して回収します
フェノール-クロロホルム抽出
古典的な有機溶媒法で、RNAを含む核酸を水層へ移して回収します
スピンカラム法
遠心力を使ってカラムにRNAを通し、沈殿させずに純化する現代的な抽出法
磁気ビーズ法
磁性ビーズに結合したRNAを磁石で分離・回収する自動化・半自動化の抽出法
市販RNA抽出キット
Qiagen RNeasy などの商用キットを使い、手軽にRNAを抽出する選択肢
DNase処理
DNAをRNAから除去する処理。DNA汚染を避けるための重要なステップ
DNase I
DNAを分解する酵素。RNA純度を高める目的で使われます
RNaseフリー
RNase汚染を避けるための作業条件・器具・試薬の状態
RNase阻害剤
RNaseの活性を抑制する試薬・薬剤
DEPC水
RNaseを不活化する作用のある処理水。RNA実験でよく使われます
RNA純度指標
RNAの不純物の程度を表す指標の総称。良好な純度は測定値で判断します
A260/280比
RNA濃度以外のタンパク質汚染を示す指標。目安は約1.8-2.0
A260/230比
有機溶媒・塩などの残留物を示す指標。目安は約2.0-2.2
Nanodrop
RNAの濃度・純度を測定する分光光度計の代表的機器名
Bioanalyzer
RNAの品質・サイズ分布を高精度に解析する自動測定装置
RIN(RNA Integrity Number)
RNAの完全性を0から10で表す指標。数値が高いほどRNAが健全
RNA量
抽出後のRNAの総量・濃度を表す指標
組織由来RNA
組織からRNAを抽出する際の対象サンプルのこと
細胞由来RNA
細胞からRNAを抽出する際の対象サンプルのこと
RNAlater
RNAを安定化させる保存液。サンプル保存時の分解を抑制します
冷凍保存
RNAを長期保存する際の低温保存(-20℃/ -80℃など)
cDNA合成
RNAを鋳型にして補足的DNA(cDNA)を作る工程。発現解析などに使用
RT-qPCR
逆転写と定量PCRを組み合わせ、RNAの発現量を測定する方法
rRNA除去
リボソームRNAを除去/除外する工程。分析対象のRNAを富ませる目的で行われることがあります

rna抽出の関連用語

RNA抽出
生体サンプル(細胞・組織・血液など)からRNAを取り出し、下流の解析に適した純度と量を確保する一連の工程。
総RNA
RNA抽出で得られるすべてのRNAの総称。mRNAやrRNA、tRNA、小さなRNAなどを含む。
mRNA
メッセージRNA。タンパク質の設計図となるRNAで、後の解析ではpoly(A)尾を持つものを濃縮することが多い。
rRNA
リボソームRNA。リボソームの主要構成要素で、総RNAの大半を占める高比率のRNA。
tRNA
転移RNA。アミノ酸を対応するmRNAのコドンへ運ぶ役割を持つRNA。
小分子RNA
約20〜200 nt程度の小さなRNA群(miRNA、siRNA、piRNAなど)を指す。
ncRNA
コードRNAの総称。タンパク質へ翻訳されないRNAの総称で、機能は多様。
RNA精製
RNAを抽出した後にDNAやタンパク質、塩類など不要な成分を取り除き、純度を高める工程。
RNA分離
RNAを他の分子から分離して取り出す作業全体を指す。
DNase処理
サンプル中のDNAを分解してDNA汚染を除く処理。
DNase I
DNAを選択的に切断する酵素。
on-column DNase処理
カラムを使ったRNA精製過程でDNAを除去する方法。
フェノール-クロロホルム抽出
有機溶媒を用いてRNAをDNA・タンパク質と分離する古典的抽出法。
フェノール法
フェノールを用いる抽出手法全般の総称。
トリゾール法
TRIzol法の総称。フェノール-クロロホム抽出とアルコール沈降を組み合わせた手法。
TRIzol法
TRIzol reagentを使い、フェノール・クロロホルム抽出とアルコール沈降でRNAを分離する方法。
Guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform法
グアニジウムチオシアネートとフェノール-クロロホルムを用いるRNA抽出の代表的手法。
カラム法
カラムを用いてRNAを結合・洗浄・エリュートする現代的抽出法。
スピンカラム法
遠心力を使ってRNAをカラムに結合させ、洗浄して回収する手法。
RNeasy Kit
QIAGEN社などのカラム法キットの代表例
裂解緩衝液
細胞や組織を破壊してRNAを放出させるための緩衝液。
洗浄バッファー
カラム洗浄時に使用される緩衝液。
エタノール沈降
エタノールを用いてRNAを沈降させ、RNAを回収する古典的工程。
イソプロパノール沈降
イソプロパノールでRNAを沈降させる工程。
A260/280比
RNA純度の指標。タンパク質汚染の有無を示す比率。
A260/230比
RNA純度の指標。有機溶媒や塩類汚染の有無を示す比率。
RIN
RNAの完全性を示す指標。値が高いほど品質が良いとされる。
28S/18S比
リボソームRNAの比率による品質指標の一つ。
Bioanalyzer
RNAの長さ分布と品質を評価する分析機器。
RNA-Seq
全転写物の発現を網羅的に測定する次世代シーケンス法。
RT-qPCR
逆転写して定量PCRを行い、RNA量や発現量を定量する基本技術。
Poly(A)選択
mRNAを選択的に濃縮する方法。poly(A)尾を持つRNAを抽出する手法。
rRNA depletion
rRNAを除去して、残りの転写物を解析しやすくする方法。
RNase-free環境
RNase混入を避けるために清浄に保たれた実験環境。
RNase inhibitors
RNase活性を抑制する試薬・酵素
RNase-free試薬
RNase汚染を避けるよう処理・管理された試薬。
RNase-free水
RNaseを含まない、滅菌済みの水。
DEPC-treated水
RNA保存のためにRNaseを不活化した水。現在はRNase-free水が主流。
保存条件 -80°C
長期保存時の推奨温度。RNAの分解を抑える
FFPEサンプル
フォーマリン固定パラフィン包埋標本。RNA抽出は難易度が高いが臨床サンプルでよく用いられる。
血液RNA
血液サンプルからRNAを抽出する特殊な条件と手法。
磁性ビーズ法
磁性ビーズを使ってRNAを捕捉・分離する自動化向きの方法。
自動化
ロボットや自動機器を用いてRNA抽出を実行するワークフロー
品質評価指標
抽出後の純度・量・完全性を評価する指標全般。

rna抽出のおすすめ参考サイト


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