分子量マーカーとは?初心者向けガイドで基本と使い方を分かりやすく解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!

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分子量マーカーとは?初心者向けガイドで基本と使い方を分かりやすく解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!
この記事を書いた人

高岡智則

年齢:33歳 性別:男性 職業:Webディレクター(兼ライティング・SNS運用担当) 居住地:東京都杉並区・永福町の1LDKマンション 出身地:神奈川県川崎市 身長:176cm 体系:細身〜普通(最近ちょっとお腹が気になる) 血液型:A型 誕生日:1992年11月20日 最終学歴:明治大学・情報コミュニケーション学部卒 通勤:京王井の頭線で渋谷まで(通勤20分) 家族構成:一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹 恋愛事情:独身。彼女は2年いない(本人は「忙しいだけ」と言い張る)


分子量マーカーとは?

分子量マーカーとは、ゲル電気泳動で分子の大きさを決めるときの標準となるサンプルのことです。タンパク質用マーカーとDNA/核酸マーカーがあり、それぞれが決まった分子量のバンドを持っています。このマーカーをゲルにロードして泳動すると、マーカーの各バンドの位置を見て、試料のバンドの分子量を推定できます。

使い方を一言でいうと、マーカーと試料を同時にゲルに入れ、電気を流して分離させ、しっかりと染色・検出してから比較する、という流れになります。この作業の正確さが、研究結果の信頼性につながります

基本的な使い方の流れ

1. マーカーをロードする。マーカーは複数のバンドを持つ標準品で、分子量が小さいものから大きいものまで幅広く分かれています。選ぶマーカーの範囲は、測りたい分子量の範囲に合わせるのがコツです。

2. サンプルと同じゲル上で泳動を行う。実験後、タンパク質なら染色・染料、DNAなら蛍光や着色剤で可視化します。

3. バンドを読み取る。マーカーのバンドの位置を基準にして、自分の試料のバンドの位置を比較します。この比較により、おおよその分子量が決まります

分子量マーカーの種類

最も一般的には、タンパク質用マーカーとDNA/核酸マーカーの2種類があります。タンパク質用は分子量(kDa)で、DNA用は塩基対長(bp)やキロベース(kb)で表示されます。混合タイプの製品もあり、ゲルの検出方法に合わせて選ぶと便利です。

種類特徴
タンパク質用マーカータンパク質の分子量を示す複数のバンドを含み、通常はkDaで表示されます
DNA/核酸マーカーDNA断片のサイズを示すバンドを含み、通常はbpやkbで表示されます
混合マーカータンパク質とDNAの両方の特性を持つ製品もあり、複数の用途に便利です

保存と取り扱いのポイント

マーカーは長期間の保存が必要になることが多く低温保存が推奨されます。製品によっては冷凍可能なもの、凍結融解回数の制限があるものなどがあるため、パッケージの指示に従いましょう。

取り扱い時は、ゲルと同様に清潔な状態で使用し、汚染を避けることが大切です。使い切った後は容器を清掃し、蓋をしっかり閉じて保管することが品質を保つコツです。

選び方のポイント

目的の分子量範囲、検出方法、ゲルのポアレンス、染色・検出の感度などを総合的に考えます。測定対象が小さいほど細かい分子量差を識別できるマーカーを選ぶのが重要です。実験前には、取扱説明書で「適応範囲」や「推奨温度」を必ず確認しましょう。

実験の具体例

例えば、タンパク質のサンプルの分子量を10kDa〜100kDaの範囲で知りたい場合、10-100kDaのタンパク質マーカーを用います。バンドの間隔や読み取りの分解能はマーカーの設計に影響します。実際の読み取りは、可視化の条件や染色の感度にも左右されます。

よくある誤解と対策

誤解: マーカーのバンドとサンプルのバンドの見た目が同じ分子量になる。実際には泳動条件などによりずれることがあるので、複数のマーカーを使い、同時に走らせることで誤差を減らします。

まとめ

分子量マーカーは、分子の大きさを測るための信頼できる目盛りです。適切な種類を選び、正しい使い方をすることで、実験結果の解釈がぐっと正確になります。


分子量マーカーの同意語

分子量標準
分子量を測定・推定する際の基準となる標準物質。ゲル電気泳動や分析の比較対象として使われる。
分子量標準物質
分子量が既知の標準物質。タンパク質や核酸の分子量を正確に比較・推定するための基準材。
分子量ラダー
連続した分子量を含む標準セット。未知の分子のサイズをゲル上で推定するためのラダー。
タンパク質分子量マーカー
タンパク質の分子量を推定するための標準マーカー。SDS-PAGE などで使用される。
DNA分子量マーカー
DNA断片の分子量(サイズ)を推定するための標準ラダー。ゲル電気泳動でDNA長を測る際に使用。
DNAラダー
DNA用の分子量ラダー。複数の既知サイズのDNA断片がセットになっている標準セット。
RNA分子量マーカー
RNA断片の長さ・分子量を推定するための標準ラダー。主に RNA 関連の実験で使用。
RNAラダー
RNA用の分子量ラダー。RNAの長さを基準に分子量を決定する標準セット。
核酸分子量マーカー
DNA・RNAなど核酸全般の分子量を推定するための標準マーカー。
ゲル電気泳動マーカー
ゲル電気泳動で分子量を推定する際に使われる標準物質の総称。タンパク質・核酸のいずれにも用いられる。
MWマーカー
英語の Molecular Weight Marker の略。分子量推定の基準として使われる表記。
MW標準
MW(分子量)の標準を指す表現。分子量を比較する際の基準物として用いられる。

分子量マーカーの対義語・反対語

分子量未知
分子量の値がまだ確定しておらず、参照として使える標準がない状態。
分子量基準の欠如
分子量を測るための信頼できる基準(標準物質)が欠けている状態。
分子量マーカー不使用
実験で分子量マーカー(標準の分子量バーや分子量ラダー)を使わない選択。
標準分子量の欠如
参照用の標準分子量が揃っていない状態(標準物質がない)。
参照標準なし
分子量を推定するための参照標準がない状況。
分子量表示なし
実験データや図で分子量の表示が含まれていない状態。
分子量推定なし
分子量を推定する処理を行わない状態。
実測の分子量データなし
実測値としての分子量データが無い状態。
分子量の参照値が未設定
分子量を判断するための参照値が設定されていない状態。
分子量基準が存在しない実験
標準となる分子量基準が用意されていない実験設計。
分子量の比較なし
複数サンプルの分子量を比較するための比較操作がない状態。
分子量データが不確定
分子量の値が確定しておらず、信頼性の低いデータとなっている状態。

分子量マーカーの共起語

SDS-PAGE
タンパク質の分子量を推定するために用いられるゲル電気泳動法。分子量マーカーはこの手法でサイズの基準となるバンドを示します。
タンパク質標準
既知の分子量を持つタンパク質の混合物。SDS-PAGEなどでサンプルの分子量を推定する基準として使われる。
分子量標準
分子量を既知にした標準品の総称。タンパク質マーカーやDNAラダーを含むことが多い。
タンパク質マーカー
タンパク質の分子量を示す標準マーカー。各バンドの分子量がラベル付けされていることが多い。
分子量マーカー
分子量を測定・推定するための標準群。タンパク質用とDNA用がある。
ウェスタンブロット
タンパク質を検出・同定する転写後の分析法。マーカーは膜上のサイズ確認にも使われる。
電気泳動
分子を電場で分離する基本技術。分子量マーカーはこの技術とセットで使われる。
ゲル電気泳動
ゲル上で行う分子分離法。サイズの目安としてマーカーが用いられる。
DNAマーカー
DNA断片の長さを推定する標準マーカー。ゲル電気泳動でサイズを判断する基準になる。
DNAラダー
既知サイズのDNA断片を連ねたラダー。DNAマーカーの代表的な形態。
ラダー
ゲル上のサイズ比較用標準サンプルの総称。DNAラダーやタンパク質マーカーを含む。
kb
キロベース。DNAの長さを基準として表す単位(1000 bpに相当)。
bp
塩基対。DNAの長さを表す基本単位
kDa
キロダルトン。タンパク質の分子量を表す一般的な単位。
Da
ダルトン。分子量の基本単位。
分子量
物質の質量を分子単位で表した値。マーカーはこの分子量を基準として使われる。
標準タンパク質
既知の分子量を持つタンパク質を集めた標準セット。サイズ推定の基準になる。
サイズマーカー
分子量を推定するためのサイズ別標準。ラダーの一般呼称。
分子量推定
マーカーのバンドとサンプルのバンド位置を比較して、サンプルの分子量を推定する作業。

分子量マーカーの関連用語

分子量マーカー
SDS-PAGEやアガロースゲル等のゲル電気泳動において、分子量が既知のタンパク質・核酸の混合物。未知サンプルと比較して分子量を推定する標準物として使われます。
分子量標準
分子量マーカーと同義で用いられることが多い、分子量が既知の標準ラダーの総称です。
タンパク質マーカー
タンパク質の分子量を目安に推定するラダー。SDS-PAGEでの使用が一般的で、バンドの位置がMWの尺度になります
DNAマーカー
DNA断片のサイズを推定するラダー。アガロースゲルでの分離に利用され、断片長(bpや kb)と位置を対応づけます。
RNAマーカー
RNA断片のサイズを推定するラダー。RNA分離用のアガロース/ポリアクリルアミドゲルで使用されます。
核酸マーカー
DNAマーカーとRNAマーカーの総称。核酸のサイズ判定に使われます。
ラダー
分子量が既知の複数の分子を含む標準サンプルのこと。サンプルの分子量を推定する基準になります。
バンド
ゲル上に現れる明瞭な帯状の線。マーカーやサンプルの分子量の目安として読み取ります。
広範囲マーカー
低MWから高MWまで幅広い分子量をカバーするラダー。さまざまなサンプルに対応します。
低分子量マーカー
小さな分子のMW範囲をカバーするラダー。小型タンパク質や小DNA断片の推定に適します。
高分子量マーカー
大きな分子のMW範囲をカバーするラダー。高分子量のタンパク質や大きなDNA断片の推定に適します。
ポリアクリルアミドゲル
タンパク質分離用のゲル。細かなMW差を分離するのに適しており、分子量マーカーと併用します。
アガロースゲル
DNAやRNAの分離に用いられるゲル。大きな断片のサイズ推定に適しています。
SDS-PAGE
タンパク質を分子量で分離するゲル電気泳動法。分子量マーカーを使ってMWを推定します。
ウェスタンブロット
SDS-PAGE後に抗体で特定タンパク質を検出する手法。分子量マーカーは検出域のMWを確認する目安になります。
標準曲線
移動距離と分子量の関係を表す曲線。未知サンプルの分子量を算出する際の変換に使います。
対数スケール
分子量は通常、対数スケールで表現され、MWと移動距離の関係を直線化します。
分子量の単位
分子量の単位はダルトン(Da)とキロダルトン(kDa)で表します。例えば、タンパク質の多くはkDaで表示されます。
移動距離
ゲル中でマーカーが移動した距離。サンプルの分子量推定時の比較指標となります。

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