proteomeとは?初心者がつかむ基本と身近な意味を徹底解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!

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proteomeとは?初心者がつかむ基本と身近な意味を徹底解説共起語・同意語・対義語も併せて解説!
この記事を書いた人

高岡智則

年齢:33歳 性別:男性 職業:Webディレクター(兼ライティング・SNS運用担当) 居住地:東京都杉並区・永福町の1LDKマンション 出身地:神奈川県川崎市 身長:176cm 体系:細身〜普通(最近ちょっとお腹が気になる) 血液型:A型 誕生日:1992年11月20日 最終学歴:明治大学・情報コミュニケーション学部卒 通勤:京王井の頭線で渋谷まで(通勤20分) 家族構成:一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹 恋愛事情:独身。彼女は2年いない(本人は「忙しいだけ」と言い張る)


proteomeとは?初心者がつかむ基本と身近な意味を徹底解説

このページでは proteome について、難しい専門用語を使わず、やさしい言葉で解説します。proteome とは「ある生物の体内にある全てのタンパク質の集合体」です。タンパク質は私たちの体を作る材料であり、筋肉・髪・臓器・細胞の働きを支える道具の役割を持っています。英語名の proteome を日本語で言い換えると「タンパク質全体」というイメージで十分理解できます。

proteomeと genomeの違い

ゲノム は生物の設計図の全体で、DNA に書かれた情報が詰まっています。これに対して proteome はその設計図を元に体内で実際に作られ、働くタンパク質の全体です。遺伝情報がどう形になるかを示す流れは、DNA → RNA → タンパク質 という連携です。理解を助ける基本的な考え方としては「設計図」(ゲノム) と「完成品」(プロテオーム) の違いを意識するとよいでしょう。

どうやって proteome を調べるのか

現代の研究では 質量分析 という機械を使い、細胞の中にある多くのタンパク質を同時に同定します。質量分析はタンパク質を小さな部品に分け、それぞれの重さを測って同定する方法です。この情報を組み合わせることで、ある生物の proteome の全体像を作ることができます。研究者はこのデータを使って、病気の原因となるタンパク質の変化を追いかけ、早期診断のヒントや新しい薬のターゲットを探します。

proteomeが私たちの生活に与える影響

proteome の理解は病気の診断・予防・治療の開発に役立ちます。例えばがんや心臓病、感染症など、さまざまな病気でタンパク質の変化を追うことで、より正確な検査や治療の選択肢が広がります。スポーツ選手の体の回復を研究する際にも、タンパク質の変化を観察することでパフォーマンス向上につながる知見が得られることがあります。

用語表と基礎知識

以下の表は、 proteome などの関連語を整理したものです。

用語
Proteome特定の生物の体内に存在するタンパク質の全体
Genome生物の設計図である遺伝情報の全体
Transcriptome遺伝子から作られるRNAの全体

まとめ

要するに、proteome は生物のタンパク質の「全体像」を表す概念です。ゲノムトランスクリプトーム と組み合わせて考えると、生命の仕組みをより深く理解できます。研究者はこの知識を使って、病気の診断・治療・予防につなげていきます。


proteomeの同意語

プロテオーム
生物の細胞・組織・個体が発現させる、全てのタンパク質の総体。ゲノム情報の発現産物を網羅した集合を指し、プロテオミクスの対象となる概念です。
タンパク質総体
同様に、発現する全タンパク質の集合。 proteome の日本語の主流な訳語のひとつとして使われます。
蛋白質総体
漢字表記の同義語。発現している全タンパク質の集合を意味します。
タンパク質全体集合
生物が発現する全タンパク質を集約した集合を指す表現。 proteome と同義に用いられることがあります。
全タンパク質集合
特定の生物・組織・条件下で発現する全タンパク質の集合を表す表現です。
タンパク質全体
文脈によって proteome の概念を指すことがある、全タンパク質の意味を持つ表現です。

proteomeの対義語・反対語

ゲノム
生物の全DNA情報の集合。遺伝情報の設計図で、タンパク質の全体像であるプロテオームと対比される概念です。
トランスクリプトーム
細胞内で発現している全RNAの集合。タンパク質の材料となる情報の層で、プロテオームとは発現の過程の別の段階として対比されます。
メタボローム
生体内の全代謝物の集合。タンパク質の働きによって作られる代謝物の全体像で、プロテオームとは異なる生体分子集合です。
非タンパク質オミクス
タンパク質以外の分子を対象とするオミクス領域の総称。脂質・核酸・糖鎖などを含み、プロテオームの対概念として使われます。
脂質オミクス
細胞膜構成脂質や脂質代謝物の全体を解析する分野。タンパク質の全体像であるプロテオームの対になる別の分子集合として扱われることがあります。
糖鎖オミクス
糖質の構造と量を全体として解析する領域。タンパク質と結合して機能に影響を与える糖鎖を含むが、プロテオームとは別の分子集合として位置づけられます。
核酸オミクス
DNA・RNAといった核酸を対象とするオミクス領域。遺伝情報の観点からプロテオームに対する別の全体像として使われます。

proteomeの共起語

タンパク質
生体を構成する基本的な機能分子。アミノ酸が連なる長い鎖状の分子で、プロテオームを構成する中心的要素です。
タンパク質発現
細胞や組織でタンパク質が作られて現れる現象。発現量の差が生物学的な違いを生みます。
発現量
特定のタンパク質がある条件下でどれだけ多くまたは少なく存在するかの量的指標。定量プロテオミクスの基本単位です。
タンパク質同定
質量分析などを用いて、試料中のタンパク質がどれかを特定する作業。実験の第一歩です。
質量分析
物質の質量を測定して組成や構造情報を得る分析技術。タンパク質の同定・定量の核となる方法です。
マススペクトロメトリー
質量分析の別称。タンパク質やペプチドの特定と定量に広く用いられます。
LC-MS/MS
液体クロマトグラフィーと質量分析を組み合わせた、複雑な試料からタンパク質を同定・定量する標準的な手法です。
ショットガンプロテオミクス
多数のタンパク質を一括して分解・分析するアプローチ。全体像を短時間で推定します。
プロテオミクス
タンパク質の発現・修飾・相互作用などを網羅的に研究する生物学の分野。
プロテオーム
特定の生物種・組織・条件で発現しているタンパク質の全体集合。時間や環境で変化します。
翻訳後修飾
タンパク質が翻訳後に付与・変更される修飾の総称。機能・局在・相互作用に影響します。
PTM
Post-Translational Modificationの略。翻訳後修飾の正式名称。
ペプチド
タンパク質を構成する短いアミノ酸の連結。質量分析でタンパク質の同定手掛かりとなります
定量プロテオミクス
タンパク質の発現量を網羅的に測定・比較する研究領域。
SILAC
同位体標識を用いた定量法。細胞内タンパク質の量を比較して定量します。
TMT
タンデム質量タグによる多条件同時定量法。複数サンプルを一度に比較可能です。
iTRAQ
同位体タグを用いた多サンプル定量法。複数条件の定量が同時に可能です。
ゲノム
生物の全遺伝情報の総称。プロテオームはゲノムが指示するタンパク質の集合です。
トランスクリプトーム
細胞で転写されるRNAの全体。発現情報の前提となり、プロテオームと連携します。
メタボローム
代謝産物全体の集合。プロテオームと相互作用して生体状態を表現します。
組織特異的プロテオーム
組織ごとに特有のタンパク質組成を持つプロテオームのこと。
プロテオームアトラス
特定条件下のプロテオームを地図のように整理・公開したデータセット
相互作用
タンパク質同士が機能的に影響し合う関係。生物学的経路の理解に不可欠です。
プロテイン–タンパク質相互作用
PPIとも呼ばれ、タンパク質同士の結合・影響関係を指します。
データベース
タンパク質情報を蓄積・提供するオンライン資料庫の総称。
UniProt
代表的なタンパク質データベース。機能・構造・修飾情報を網羅します。
GO
Gene Ontologyの略。タンパク質の機能・場所・生物学的プロセスを分類します。
生物情報学
データ解析・解釈の基盤となる情報科学の分野。プロテオミクス解析にも必須の分野です。
データ解析
実験データを統計・計算で解釈する工程。定量・同定の基盤となります。
データベース解析
公開データベースを活用して知識を統合・検索する作業。

proteomeの関連用語

プロテオミクス
大規模にタンパク質を同定・定量・機能を解析する研究分野。
ショットガンプロテオミクス
多くのタンパク質を含む試料を一括して同定・定量する、現代の高スループット手法。
定量プロテオミクス
タンパク質の相対量・絶対量を比較・推定する手法群。
ターゲットプロテオミクス
特定タンパク質を高感度で測定する定量法(SRM/MRM/PRM など)。
質量分析
タンパク質を構成する質量と構造情報を測定する分析技術。
LC-MS/MS
液体クロマトグラフィーと質量分析を組み合わせ、ペプチドを同定・定量する主要手法。
ポスト翻訳修飾
翻訳後にタンパク質へ付与される化学修飾。例:リン酸化、糖鎖付与、ユビキチン化
トランスクリプトーム
細胞・組織で発現している全RNAの集合。
トランスクリプトミクス
RNA発現を網羅的に解析する研究分野。
ゲノム
生物の全遺伝情報。
メタボローム
全代謝産物の網羅的な集合。
スペクトルライブラリ
既知のペプチドスペクトルのデータ集合で、同定の照合に使われる。
データベース検索
得られたスペクトルを既知データベースと照合してタンパク質を同定する処理。
UniProt
タンパク質の配列・機能・局在などをまとめた主要データベース
タンパク質アノテーション
機能・局在・相互作用など、タンパク質についての追加情報。
タンパク質-タンパク質相互作用
タンパク質同士が相互作用する関係性の情報。
ヒトプロテオームアトラス
ヒトのタンパク質分布を組織・細胞レベルで可視化した公開データベース。
ヒトプロテオームプロジェクト
ヒト全タンパク質の網羅的マッピングを目指す国際プロジェクト。
血漿プロテオーム
血漿中のタンパク質の総体。
オルガネラプロテオーム
ミトコンドリア・核など細胞のオルガネラ別タンパク質集合。
ファンクショナルプロテオミクス
タンパク質の機能や作用を網羅的に理解するアプローチ
プロテオームデータ解析
大規模プロテオミクスデータの統計処理・解釈。
プロテオゲノミクス
ゲノム情報とプロテオミクス情報を統合して新規タンパク質を同定する分野。
サンプル調製
プロテオミクス用にタンパク質を抽出・消化・クリーンアップする前処理。
内部標準
定量の際に用いる基準タンパク質・ペプチド
ProteomeXchange
プロテオミクスデータの公開・共有を行う国際プラットフォーム。
バイオマーカーディスカバリー
疾病の新規生体マーカーをプロテオミクスで探索する活動。
標準化・品質管理
実験・データ処理の一貫性と信頼性を保つための基準作業。

proteomeのおすすめ参考サイト


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