nanodrop とは？初心者向けガイドで分かる使い方と基礎知識共起語・同意語・対義語も併せて解説！

この記事を書いた人

高岡智則

年齢：33歳性別：男性職業：Webディレクター（兼ライティング・SNS運用担当）居住地：東京都杉並区・永福町の1LDKマンション出身地：神奈川県川崎市身長：176cm 体系：細身〜普通（最近ちょっとお腹が気になる）血液型：A型誕生日：1992年11月20日最終学歴：明治大学・情報コミュニケーション学部卒通勤：京王井の頭線で渋谷まで（通勤20分）家族構成：一人暮らし、実家には両親と2歳下の妹恋愛事情：独身。彼女は2年いない（本人は「忙しいだけ」と言い張る）

nanodrop とは

nanodrop は微量サンプルの濃度を測る装置です。少量の試料でDNAやRNA、タンパク質の濃度を測定でき、研究現場で広く使われています。従来の分光光度計よりも小さなサンプルで済み、結果もすぐ出せます。

どんな場面で使うのか

遺伝子の抽出後の濃度を確認したいとき、PCR前の品質チェック、タンパク質の純度評価などに使います。

測定の原理

nanodrop は光を試料に照射して、吸収された光の量から濃度を推定します。主に260nmと280nmの波長を使いA260/A280比でDNA/RNAの純度を判断します。またA260/A230比も評価指標として使われ、溶媒由来の汚染を示すことがあります。

使い方の基本

操作はとてもシンプルです。まずデバイスを起動し、ブランク測定を行います。次にサンプルの微量をチップにのせ、測定します。測定後はチップを適切に拭いて清掃します。推奨サンプル量は通常1～2μL程度です。

データの読み方と解釈

表示される数値は主に濃度と比です。濃度は ng/μL または ng/μL の単位で表示されます。A260/A280 が約1.8～2.0ならDNA/RNAの純度が高いとされ、1.6～1.8はやや不純物あり、特にタンパク質汚染を疑うことがあります。A260/A230 が2.0前後が目安です。

基本情報

特徴	少量サンプルで濃度測定
最小サンプル量	約1～2μL
測定波長	主に260nm・280nm・230nm
用途	DNA/RNA/タンパク質の濃度と純度評価
長所	迅速、試料の節約、操作が簡単
注意点	サンプルの蒸発防止と清浄、反射の影響に留意

よくある誤解と注意点

nanodrop は万能ではありません。有機溶媒や塩の高濃度などで測定値が崩れることがあります。また、低濃度のサンプルでは誤差が大きくなることもあるため、適切な作業と適切な希釈が大切です。日常的にはブランクを忘れず、測定前後の清掃を丁寧に行いましょう。

まとめ

nanodrop は研究現場でよく使われる便利な装置です。小さなサンプル量で速く濃度と純度を把握できる点が魅力です。正しい使い方とデータの読み方を覚えれば、研究の効率がぐっと上がります。

nanodropの同意語

NanoDrop: ブランド名の微量サンプル用分光光度計。ごく少量のサンプル（約1–2 μL程度）でDNA/RNA/タンパク質の濃度を測定できる、マイクロボリューム測定器の代表格です。
ナノドロップ: 日本語表記のブランド名。小容量サンプルを素早く測定できる分光光度計として広く使われています。
NanoDrop_ND_1000: NanoDrop ND-1000は初期モデルの代表機。微量サンプル測定に特化した分光光度計です。
NanoDrop_One: NanoDrop Oneシリーズのモデル。1サンプル対応の小容量型分光光度計で、操作性とデータ管理機能を重視しています。
NanoDrop_OneC: NanoDrop OneCはOneシリーズの派生モデル。追加機能やソフトウェア連携などの違いを持つ場合があります。
NanoDrop_2000c: NanoDrop 2000cは2チャンネル対応のモデル。2サンプル同時測定など、ワークフローの効率化が特徴です。
NanoDrop_2000: NanoDrop 2000は2000シリーズのモデル群。マイクロボリューム測定を想定した設計が特徴です。
マイクロボリューム分光計: 微量の試料（μL単位）で濃度を測定できる分光光度計の総称。NanoDropのカテゴリにも含まれます。
小容量サンプル用分光光度計: 少量サンプルを前提とした測定機器の表現。DNA/RNA/タンパク質の濃度定量に適しています。
微量測定分光計: 微量の試料を測定することに特化した分光光度計の一般的な表現。
少量試料測定機: 少量のサンプルを測定することを目的とした機器の別称。
UV-Vis微量測定機: 紫外可視領域で微量サンプルを測定するタイプの分光光度計の表現。
分光光度計_マイクロボリューム型: マイクロボリューム測定に対応する分光光度計の分類表現。

nanodropの対義語・反対語

マクロ: nanodrop の対義語。サイズ・スケールが大きいことを意味する。日常会話では『マクロサイズ／巨視的』のニュアンスで使われます。
巨視的: nano の対義語的表現。肉眼で観察できるような大きいスケールを指す言い方。
大容量: nanodrop が微量測定を前提とするのに対して、試料量が大きいことを意味します。大型サンプルを扱う文脈で使われます。
大型滴: nanodrop の『drop（滴）』に対する対義として、『大型の滴』を想定した表現。
マクロ分光法: 小容量・微量を測る nanodrop の反対概念として、マクロ容量の試料を用いる分光法を指す表現。
マクロ分光計: マクロ分光法を実現する器具。大容量サンプル向けの測定機を指す言い方。
通常ボリューム測定: nanodrop の微量測定に対して、通常のボリュームを使う測定方法を表す。
大容量測定: 大容量の試料を対象とする測定。nanodrop の微量測定の対義語的表現。

nanodropの共起語

DNA: 核酸の代表例。ナノドロップで濃度と純度を評価する主要な測定対象。
RNA: 核酸の1つ。DNAと同様に濃度と純度を評価対象。
タンパク質: タンパク質。A280等の指標で濃度と純度を評価する対象。
濃度: 試料中の物質の濃さ。出力は ng/μL や μg/mL などの単位で表示される。
ng/μL: 濃度の単位。1 μLあたりのナノグラム数を表す。
μg/mL: 濃度の別の単位。1 mLあたりのマイクログラム数を表す。
A260: 260 nm 波長での吸光度。核酸の濃度推定に使われる指標。
A280: 280 nm 波長での吸光度。タンパク質純度の確認に使われる指標。
A230: 230 nm 波長での吸光度。有機汚染や溶媒由来の背景を示す指標。
A260/A280: 260 nm と 280 nm の吸光度比。純度の目安。DNA/RNAは約1.8–2.0、タンパク質混入で低下。
A260/A230: 260 nm と 230 nm の吸光度比。有機汚染や溶媒汚染の補足指標。
260/280比: A260/A280比の別表現。核酸純度の目安として用いられることが多い。
260/230比: A260/A230比の別表現。汚染の有無を補足的に評価する指標。
波長範囲: Nanodrop が測定可能な波長範囲。概ね190–320 nm程度で核酸・タンパク質の測定に適用。
UV-Vis: 紫外可視分光法。吸光度測定の基本原理を指す略語。
吸光度: 光が試料を吸収した度合いの指標。測定値として結果に表示される。
データ出力: 測定結果を表形式や数値データとして出力・保存できる機能。
サンプル体積: 測定に必要な試料の容量。Nanodrop は非常に少量で測定可能。
最小サンプル量: 測定に必要な最小限のサンプル量。装置やモデルに依存するが少量で済む点が特徴。
ソフトウェア: 測定データを解析・表示する付属ソフトウェア。
NanoDrop: 機器のブランド名。小量サンプルでの濃度・純度測定を行う分光光度計。
ナノドロップ: 日本語表記の別称。NanoDropと同義。
ブランド: Thermo Fisher Scientific（NanoDrop の製造元）など。

nanodropの関連用語

Nanodrop: 微量サンプル（約0.5–2 μL）を用い、UV-VisスペクトロスコピーでDNA/RNAの濃度と純度を同時に測定する専用の測定機器。小ボリュームで迅速な品質チェックに向く。
NanoDrop One: Thermo Scientific製の最新モデル。自動ブランク補正や高感度測定、複数サンプルの連続測定などが特徴。
NanoDrop 2000: 従来型のNanoDropシリーズ。0.5–2 μLの微量サンプルで濃度と純度を一度に測定する基本モデル。
UV-Vis分光法: 紫外可視光を試料に照射し、各波長での光の吸収度を測定する分析手法。核酸やタンパク質の濃度推定に用いられる。
吸光度（Absorbance, A）: 光が試料に吸収された程度を表す値。波長ごとにA値を読み取る。
A260: 260 nmでの吸光度。DNA/RNAの濃度推定に最も重要な波長。
A280: 280 nmでの吸光度。タンパク質の存在・量を反映する指標として使われる。
A230: 230 nmでの吸光度。有機汚染物質や塩類・界面活性剤の混入を示す指標として用いられる。
260/280比: DNA/RNAの純度指標。目安はDNAで約1.8–2.0、RNAで約2.0。高純度ほど理想的。
260/230比: 有機汚染・塩類・界面活性剤などの混入を示す指標。一般的には2.0前後が望ましいがサンプルにより異なる。
DNA濃度換算係数: A260×50 ng/μL → DNA濃度の目安（ dsDNA の場合）。
RNA濃度換算係数: A260×40 ng/μL → RNA濃度の目安。
ssDNA濃度換算係数: A260×33 ng/μL → ssDNAの濃度の目安。
ビールの法則（Beer-Lambertの法則）: A = εlc に基づき、吸収度と濃度・光路長の関係を説明する基本原理。測定値から濃度を導く根拠。
パス長: 測定に使われる光路長。NanoDropは微量サンプル用に非常に短いパス長を採用している（概ね約1 mm程度）。
ブランク（Blank）: 測定前に溶媒（水・緩衝液）をブランクとして設定し、基準値を差し引いて正確に測定する工程。
測定サンプル量: 約0.5–2 μL程度の微量サンプルで測定。サンプル量が少ないほど迅速に評価可能。
干渉物質・有機汚染: フェノール系・有機溶媒・界面活性剤・EDTA・高濃度塩類などは吸光度を歪め、読み値を悪化させる原因になる。
下流アプリケーションへの影響: 適切な濃度と純度を確保できないとPCR・qPCR・シーケンシング・ライブラリ調製などの結果に影響が出る。
Qubitなど蛍光法との併用: 蛍光法（例：Qubit）とは感度と特異性が異なるため、 Nanodropで粗い指標を得た後、蛍光法で正確な濃度を確認すると信頼性が上がる。
RNAの品質指標（RIN）: RNAの完全性を表す指標で、Nanodropだけでは算出できないため、別の機器（Bioanalyzer等）で測定して補助的に用いることが多い。
測定範囲と限界: 微量サンプルの測定は迅速だが、極端な濃度・色素・濁り・高汚染のサンプルでは誤差が大きくなる場合がある。
ソフトウェア/データ表示: 測定結果はA260/A280/A230、濃度、サンプル名、日付などをソフトウェア上で表示・記録・保存できる。
モデル別特徴: 各モデルで感度・測定範囲・自動ブランク補正・ソフトウェア機能が異なるため、用途に応じて選ぶ。